Genomische Heterozygotie
Die genomisch gemessene Heterozygotie beschreibt den prozentualen Anteil der Genorte eines Tieres, an dem zwei unterschiedliche Allele vorliegen. Die Methode der Wahl ist die Bestimmung mittels SNP-Arrays, die tausende Marker im Erbgut präzise analysieren. Der Wert zeigt damit die tatsächliche genetische Vielfalt des untersuchten Individuums. Eine hohe Heterozygotie deutet auf eine breite genetische Grundlage hin, die oft mit guter Anpassungsfähigkeit (genetische Fitness) und robuster Gesundheit verbunden ist. Niedrige Heterozygotie kann dagegen auf Inzucht oder enge Verwandtschaft in der Ahnenreihe hinweisen und birgt ein erhöhtes Risiko für Erbkrankheiten.
Beachten Sie bitte:
Es wird oft nachgefragt, ob die SNP-Markerprofile, die zur Bestimmung der genetischen Identität eingesetzt werden, auch für die Bewertung der Heterozygotie/genetischen Vielfalt genutzt werden können. Eine Beispiel für ein solches IDMarkerset wäre das sog. ISAG2020-Markerset für Hunde.
Der Vergleich zeigt, dass die aus den ID-Profilen ermittelten Werte erheblich von den Array-basierten Werten abweichen.
Eigene Untersuchungen zeigen, dass die ID-basierten Werte dabei fast ausschließlich fälschlicherweise weit höher liegen, als die realen Array-basierten Werte. Dies ist nicht überraschend, denn die Marker für das ID-Profil wurden unter den speziellen Anforderungen zur Identitäts- und Abstammungsbestimmung ausgewählt und decken dazu nur einen verschwindend geringen Anteil des Gesamtgenoms ab.
Wiss. Veröffentlichungen, die belegen würden, dass ID-Profil-Markerwerte eine verlässliche Basis zur Bestimmung der individuellen Inzuchtlage und Heterozygotie/genetischen Vielfalt wären, liegen nicht vor. Bekannt dagegen ist, dass in einer Population die Verarmung der Heterozygotie in den ID-Markern ein Indiz für eine fortgeschrittene Inzucht in dieser Population sein kann.
| Tier-ID | ISAG2020 | 170k-Array | Diff_abs. |
|---|---|---|---|
| 1_16_43 | 36,4 % | 24,1 % | 12,3% |
| 1_23_17 | 41,3 % | 28,7 % | 12,6 % |
| 1_24_190 | 29 % | 23 % | 6 % |
| 1_20_59 | 43,6% | 27,5 % | 16,1 % |
SNP-Markerwerte, die zur Bestimmung der genetischen Identität eines Tieres erhoben wurden, sind nicht geeignet für die Berechnung der korrekten individuellen genomischen Heterozygotie.