ROH-Profile

Runs of Homozygosity (ROH) sind zusammenhängende Bereiche im Genom, in denen ein Individuum von beiden Elternteilen identische genetische Abschnitte geerbt hat. Im ROH Profil wird die Verteilung von ROHs auf den einzelnen Chromosomen (einschließlich ihrer Länge) abgebildet. Tiere, die stark ingezüchtet sind, zeigen einen hohen ROH-Anteil in ihrem Genom.

Zusätzlich gibt das ROH-Profil Aufschluss darüber, ob die gemessene Inzucht durch eine Inzuchtverpaarung der Eltern oder Großeltern (also jüngere Inzuchtereignisse) entstanden ist, oder ob sie populationsbedingt ist (also, ob die Population an sich einen sehr hohen Inzuchtwert aufweist).

Test und Ergebnisse

ROH Profile

In der Tierakte im Bereich Genetische Vielfalt werden die Ergebnisse des Tests Inzucht&Fitness dargestellt. Das ROH-Profil ist Teil dieser Analyse.

Hier sind beispielhaft die ROH-Profile von zwei Hunden abgebildet: rechts ein stark ingezüchteter Hund mit einem Genomischen Inzuchtkoeffizient von über 40% (Dieser Wert entsteht, wenn über mehrere Generationen eng verwandte Individuen, wie z.B. Vollgeschwister, verpaart werden) und links ein Hund mit einem niedrigen Anteil von unter 10%, was für ein gutes Zuchtmanagement spricht.

ROH Profile (stark ingezüchtet und wenig ingezüchtet)

Die Darstellung erfolgt mithilfe eines Balkendiagramms, das jedes Chromosom als rosa Balken darstellt und in Schwarz darauf die ingezüchteten Abschnitte abbildet. Die Chromosomen sind von links nach rechts auf der x-Achse angeordnet, während die y-Achse die Größe der Chromosomen und der Inzuchtabschnitte darstellt.
Im Filtermenü kann man auswählen, auf welche Weise die ingezüchteten Abschnitte auf den Chromosomen angezeigt werden:

Chromosomen und individuelle ROH-Verteilung je Chromosom: Ist die Standardanzeige, die auch im Beispiel in 1. beschrieben ist.
Rassetypische ROH-Islands (sofern verfügbar): Zeigt ingezüchtete Abschnitte, die bei einer Rasse fixiert und somit typisch sind.
% Anteil der ROH in einem Chromosom: Zeigt wie viel Prozent eines Chromosoms insgesamt von Inzucht betroffen sind.
Gesamtumfang der ROH pro Chromosom: Zeigt die absolute Länge der ROHs auf einem Chromosom im Verhältnis zu dessen absolute Länge.